Neben dem manuellen durchsuchen Ihrer Festplatten in den Modi „Schnelltest“, „Smartscan“, „Detailscan“ und „Eigener Scan“ überwacht ein Dateiwächter den Rechner und schlägt Alarm, sobald es Auffälligkeiten aufspürt. Enttarnte Bedrohungen verschiebt Emsisoft Anti-Malware in die Quarantäne oder entfernt die Schädlinge endgültig vom System. Neben weiteren Extras wie Verhaltensanalysen und Surf-Schutz zeigt Emsisoft Anti-Malware diejenigen Programme an, die sich in die Registry eingenistet haben und beim Booten von Windows automatisch mit starten. Der automatische Start einzelner, unerwünschter Anwendungen lässt hier deaktivieren.
Nach der 30-tägigen Testphase von Emsisoft Anti-Malware mit allen Funktionen wechselt die Software in den eingeschränkten Freeware-Modus. Sie können Emsisoft Anti-Malware dann als kostenlosen Malware-Scanner zum Aufspüren von Schädlingen nutzen. Erweiterte Funktionen wie der Dateiwächter oder der Surf-Schutz stehen in der Freeware-Variante nicht mehr zur Verfügung.
Emsisoft Anti-Malware ist der Nachfolger von a-squared Anti-Malware und a-squared Free.